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Na área social a Fundação também tem desenvolvido, gerenciando e executando diversos projetos atendendo a comunidade local. Em 1999 a FUNDAÇÃO MAR realizou o Projeto Marmanjo, um curso de capacitação náutica para 260 adolescentes de 1º e 2º graus das escolas do município de São Sebastião, em parceria com a iniciativa privada, Governos Federal, Estadual e Municipal. As matérias náuticas abordadas no curso foram: mergulho livre, manutenção com fibra de vidro, mecânica, marinharia, meio ambiente, legislação, pesca e história da região. Outro Projeto desenvolvido pela FUNDAÇÃO MAR é o Projeto Viração, iniciado em 1998 que atendeu 140 crianças carentes de 7 a 11 anos do Bairro da Topolândia que estão mais susceptíveis ao risco social em nossa cidade, devido à falta de estrutura familiar em que vivem. Estas crianças são orientadas a freqüentarem o projeto no período em que se encontram sem atividades escolares. Em junho de 2002, iniciou-se o Projeto S.O.S. Bombeiros no resgate da Cidadania, em parceria com FUNDAÇÃO MAR, Prefeitura de São Sebastião e Governo de São Paulo, com o objetivo de proporcionar a crianças e adolescentes, em situação de risco social e com dificuldades na aprendizagem. O programa de complementação escolar utiliza-se de conteúdos de arte e educação, meio ambiente, esporte náutico, histórico cultural e valorização da cidadania, visando a sua inclusão na sociedade. Escola Náutica e Ecoturismo Através da realização destes projetos sociais a Fundação tem prestado sua contribuição ao Município, que devido a estes e outros projetos realizados no último ano, fez com que o Prefeito Municipal recebesse da Fundação Abrinq - Pelos Direitos das Crianças, o título de "Prefeito - Criança - 2000".

A Fundação também oferece nos finais de semana e durante o ano todo, um curso de mergulho autônomo, com aulas práticas e teóricas em instalações próprias e com instrutor credenciado e certificado internacional. Todos estes projetos continuam sendo executados pela Fundação e tem atingido satisfatoriamente seus objetivos, apesar da falta de recursos para implementá-los de forma adequada. A FUNDAÇÃO MAR está buscando novas parcerias, junto à iniciativa privada e ao poder público, no intuito de captar recursos para dar continuidade a seus projetos e poder executá-los dentro de um patamar de excelência de qualidade.